学院目前建有科研实验平台12个，其中国家级平台1个，省部级平台8个，校级平台3个：
1.国家环境保护湿地生态与植被恢复重点实验室
2.植被生态科学教育部重点实验室
3.吉林省生态恢复与生态系统管理实验室
4.吉林省动物资源保护与利用重点实验室
5.吉林省生态安全与环境灾害预警研究中心
6.吉林省城市污水处理与水质保障科技创新中心
7.吉林省水污染控制与资源化工程实验室
8.吉林省农业气象灾害风险评估与防控科技创新中心
9.吉林省遥感信息技术应用创新基地灾害监测预警与评估中心
10.东北师范大学环境工程研究中心
11.东北师范大学综合灾害风险管理研究中心
12.东北师范大学自然灾害研究所
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